Jelátviteli útvonalak rendszerszintű adatbázisa és elemzése új fehérjefunkciók, jelátviteli keresztbeszélgetések és gyógyszercélpont-jelöltek meghatározása /
A különböző diszciplínák integrálása, és az eredmények hálózatos módszerekkel történő vizsgálata a jelátviteli útvonalak kutatásának egy új irányzata. A bemutatott munkában öt terület, a biokémia, a genetika, a sejtbiológia, a bioinformatika és rendszerbiológia eredményeit és módszereit integráltam,...
Elmentve itt :
| Szerző: | |
|---|---|
| További közreműködők: | |
| Dokumentumtípus: | Disszertáció |
| Megjelent: |
2011-11-28
|
| Tárgyszavak: | |
| doi: | 10.14232/phd.834 |
| mtmt: | 2774806 |
| Online Access: | http://doktori.ek.szte.hu/834 |
| Tartalmi kivonat: | A különböző diszciplínák integrálása, és az eredmények hálózatos módszerekkel történő vizsgálata a jelátviteli útvonalak kutatásának egy új irányzata. A bemutatott munkában öt terület, a biokémia, a genetika, a sejtbiológia, a bioinformatika és rendszerbiológia eredményeit és módszereit integráltam, hogy három többsejtű élőlény (a Caenorhabditis elegans, a Drosophila melanogaster és az ember) jelátviteli útvonalainak hálózatát felépítsem egy erre a célra készített programkörnyezetben. A gyűjtést manuálisan és egységes szabályok szerint végeztem, bioinformatikai forrásokat és tudományos publikációkat alkalmazva. A létrejött hálózati adatbázis, amelyet SignaLinknek neveztünk el, 8 útvonal fehérjéit és irányított kapcsolatait tartalmazza, és megjelöli a jelátviteli kapcsolatok eredeti hivatkozásait. Az adatbázison elvégzett elemzések során új jelátviteli fehérjéket, szövet- és betegségspecifikus cross-talk fehérjéket, a jelátviteli hálózat felépítése és működése szempontjából fontos kulcsfehérjéket és új gyógyszercélpont-jelölteket azonosítottunk. Az doktori munkám során kapott új tudományos eredményeim a következők: 1. Egységes gyűjtési szabályrendszer alapján létrehoztam a SignaLink adatbázist, hogy megalapozzam a jelátvitel rendszerszintű és összehasonlítható elemzését. 2. Összeállítottam három többsejtű faj, a C. elegans, a D. melanogaster és a H. sapiens 8 jelátviteli útvonalának hálózatát, és 253 új jelátviteli komponenst (szignalógot) azonosítottam. 3. Rendszerszintű elemzéssel a jelátviteli hálózat jelterjedésében és evolúciójában kritikus 192 kulcsfehérjét azonosítottunk. 4. Megvizsgálva a szignalógok és a cross-talkban fontos fehérjék tulajdonságait, sikerült kiemelnem 30 ígéretes, új gyógyszercélpont-jelöltet és az 57 kritikus pont gyógyszerészeti fontosságát. |
|---|