A Fragmenting Protocol with Explicit Hydration for Calculation of Binding Enthalpies of Target-Ligand Complexes at a Quantum Mechanical Level

QR kód

A Fragmenting Protocol with Explicit Hydration for Calculation of Binding Enthalpies of Target-Ligand Complexes at a Quantum Mechanical Level

Optimization of the enthalpy component of binding thermodynamics of drug candidates is a successful pathway of rational molecular design. However, the large size and missing hydration structure of target-ligand complexes often hinder such optimizations with quantum mechanical (QM) methods. At the sa...

Teljes leírás

Elmentve itt :

Bibliográfiai részletek
Szerzők:	Horváth István Jeszenői Norbert Bálint Mónika Enikő Paragi Gábor Hetényi Csaba
Dokumentumtípus:	Cikk
Megjelent:	2019
Sorozat:	INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 20 No. 18
doi:	10.3390/ijms20184384
mtmt:	30792970
Online Access:	http://publicatio.bibl.u-szeged.hu/17132

Hasonló tételek

Investigation of protein–ligand interactions of targets with solvent-exposed binding sites
Szerző: Wéber Edit
Megjelent: (2012)

Determination of binding capacity and adsorption enthalpy between Human Glutamate Receptor (GluR1) peptide fragments and kynurenic acid by surface plasmon resonance experiments
Szerző: Csapó Edit, et al.
Megjelent: (2014)

Binding characteristics, G-protein activation and receptor regulatory mechanisms of opioid ligands
Szerző: Bozó Beáta
Megjelent: (2000)

On the permutability condition of quantum mechanics
Szerző: Foiaş Ciprian, et al.
Megjelent: (1960)

Enthalpy Differences of the n-Pentane Conformers
Szerző: Csontos József, et al.
Megjelent: (2016)

Proteomimetic surface fragments distinguish targets by function
Szerző: Tököli Attila, et al.
Megjelent: (2020)

Determination of binding capacity and adsorption enthalpy between Human Glutamate Receptor (GluR1) peptide fragments and kynurenic acid by surface plasmon resonance experiments. Part 2 Interaction of GluR1270–300 with KYNA /
Szerző: Csapó Edit, et al.
Megjelent: (2015)

Hydration and oil binding properties of raw and germinated alfalfa seeds and sprouts as novel gluten-free ingredients
Szerző: Djordjević Marijana, et al.
Megjelent: (2022)

Quantum mechanical scattering by time-periodic potentials
Szerző: Szabó Lóránt Zsolt
Megjelent: (2019)

Comparison between quantum and classical calculations for above threshold ionization of argon
Szerző: Orimo Yuki, et al.
Megjelent: (2019)

Targeting the cannabinoid and mu opioid receptors with heterodimerized and allosteric ligands
Szerző: Dvorácskó Szabolcs
Megjelent: (2019)

Isoxazole‐Based Compounds Targeting the Taxane‐Binding Site of Tubulin
Szerző: Peřina Miroslav, et al.
Megjelent: (2025)

Nature and properties of acidic sites in zeolites revelaed by quantum chemical ab initio calculations
Szerző: Sauer J.
Megjelent: (1985)

Binding and signalling properties of alkaloid and peptide ligands acting at the mű opioid receptors
Szerző: Monory Krisztina
Megjelent: (1999)

Synthesis and binding properties of novel selective 5-HT3 receptor ligands
Szerző: Modica Maria N., et al.
Megjelent: (2004)

Ligand binding constants of the cucurbit[7]uril predicted with molecular docking a theoretical study /
Szerző: Roósz Balázs, et al.
Megjelent: (2018)

Protocol ; Protocol or study plan
Szerző: Kéki Miklós
Megjelent: (2015)

Novel perspectives of target-binding by the evolutionarily conserved PP4 phosphatase
Szerző: Kármán Zoltán, et al.
Megjelent: (2020)

Receptor binding and functional biochemical studies on synthetic μ-opioid receptor selective ligands
Szerző: Tóth Fanni
Megjelent: (2006)

On local automorphisms of some quantum mechanical structures of Hilbert space operators
Szerző: Gyenti Bálint, et al.
Megjelent: (2020)

Autizmus és explicit tanulás
Szerző: Chezan Júlia
Megjelent: (2013)

Investigating Explicitation Strategies in Subtitling
Szerző: Kovács Péter
Megjelent: (2014)

Fragmentation of cyclobutane derivatives upon electron impact transformation pathways elucidated by mass spectrometric methods and semiempirical quantum chemical calculations /
Szerző: Pálinkó István, et al.
Megjelent: (1998)

Quantum control with quantum light of molecular nonadiabaticity
Szerző: Csehi András, et al.
Megjelent: (2019)

Bismuth(III)-Catalyzed Hydration of Terminal Alkynes Sustainable Synthesis of Methyl Ketones in Batch and Flow /
Szerző: Ötvös Sándor Balázs, et al.
Megjelent: (2019)

Quantum chemical calculations of model systems for ascorbic acid adducts with Schiff bases of lysine side chains possibility of /
Szerző: Otto Peter, et al.
Megjelent: (1979)

Design of ligand anchored polymeric nanoparticles for potential targeted drug delivery in intestinal inflammation
Szerző: Zeeshan Mahira, et al.
Megjelent: (2022)

Targeting the blood-brain barrier with solid and vesicular nanoparticles decorated with ligands of solute carriers
Szerző: Mészáros Mária
Megjelent: (2019)

Target-specific NMR detection of protein–ligand interactions with antibody-relayed 15N-group selective STD
Szerző: Hetényi Anasztázia, et al.
Megjelent: (2016)

Modeling hydrogen bonding interactions in α-substituted cinnamic acid ester derivatives by semiempirical quantum chemical calculations
Szerző: Körtvélyesi Tamás, et al.
Megjelent: (2000)

Study of phenanthrenes from their unique mass spectrometric behavior through quantum chemical calculations to liquid chromatographic quantitation
Szerző: Körmöczi Tímea, et al.
Megjelent: (2025)

Explicit vs. Implicit stratégiai célok?
Szerző: Hajas Gábor Péter
Megjelent: (2018)

The DNA-binding box of human SPARTAN contributes to the targeting of Poleta to DNA damage sites
Szerző: Tóth Ágnes, et al.
Megjelent: (2017)

Preparations for the measurements of gas-hydrate crystal clouds in the outer solar system
Szerző: Bérczi Szaniszló
Megjelent: (1993)

Combination of Alanine and Glutathione as Targeting Ligands of Nanoparticles Enhances Cargo Delivery into the Cells of the Neurovascular Unit
Szerző: Porkoláb Gergő, et al.
Megjelent: (2020)

Routing protocols [abstract] /
Szerző: Kurucz Gábor, et al.
Megjelent: (2004)

C‐terminal Cysteines of CueR Act as Auxiliary Metal Site Ligands upon Hg II Binding—A Mechanism To Prevent Transcriptional Activation by Divalent Metal Ions?
Szerző: Balogh Ria Katalin, et al.
Megjelent: (2019)

Multi-partite quantum optical systems for quantum information processing
Szerző: Gábris Aurél
Megjelent: (2007)

Carbon Quantum Dots The Role of Surface Functional Groups and Proposed Mechanisms for Metal Ion Sensing /
Szerző: Shabbir Hasan, et al.
Megjelent: (2023)

Changing the Basis of Contextual Representations with Explicit Semantics
Szerző: Ficsor Tamás, et al.
Megjelent: (2021)